まずはDBを変換
データベースのダンプを取得する。

データベースのダンプの CHARSET 部分 ujis -> utf8 へ

sed s/ujis/utf8/g < mysql.dump > mysql_utf.dump

phpmyadmin からデータベースを作成
utf8_general_ci

データベースに復元する

mysql -u DBUSER --password=DBPASS DBNAME < mysql_utf.dump

管理画面から文字コードを ja_utf8に変更する

テーマファイルのエンコーディングが EUCだったので UTF-8 に変換した。